安藤 耕司

東京女子大学 現代教養学部 数理科学科 情報理学専攻

English



最近の論文

  1. C. Okamoto and K. Ando, Molecular dynamics simulation analysis of structural dynamic cross correlation induced by odorant hydrogen-bonding in mouse eugenol olfactory receptor. Biophys. Physicobiol. 21, e210007 (2024). / arXiv / bioRxiv
  2. K. Ando, Potential energy surfaces for electron dynamics from a model of localized Gaussian wave packets with valence-bond spin-coupling: high-harmonic generation spectra from H and He atoms. Chem. Phys. 570, 111883 (2023). / arXiv
  3. 荒木貴絵, 安藤耕司, 味覚受容体タンパクとリガンドの相互作用に関する分子動力学シミュレーション, J. Comp. Chem. Jpn.21, 94-95 (2022).
  4. H. Kitoh-Nishioka, R. Sato, Y. Shigeta, K. Ando, Linear Combination of Molecular Orbitals of Fragments (FMO-LCMO) Method: Its Application to Charge Transfer Studies. Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method, 391-405 (2021).
  5. T. Joutsuka and K. Ando, Efficient Free-Energy Calculation of Proton Transfer by Constrained Density Functional Theory and Geometrically Restrained Molecular Dynamics Simulation, Chem. Lett. 50, 1325-1328 (2021).
  6. 岡本千怜, 安藤耕司, 分子動力学シミュレーションによる嗅覚受容体タンパク質mOR-EGと香り分子オイゲノールの結合解析, J. Comp. Chem. Jpn.19, 161-163 (2020).
  7. T. Joutsuka and K. Ando, Constrained Density Functional Theory Molecular Dynamics Simulation of Deprotonation in Aqueous Silicic Acid, J. Phys. Chem. B 124, 8323-8330 (2020).
  8. H. Kitoh-Nishioka, Y. Shigeta, and K. Ando, Tunneling matrix element and tunneling pathways of protein electron transfer calculated with a fragmet molecular orbital method, J. Chem. Phys. 153, 104104 (2020).
  9. K. Ando, Single-electron quantum dynamics in high-harmonic generation spectrum from LiH molecule: analysis of potential energy surfaces for electrons constructed from a model of localized Gaussian wave packets with valence-bond spin-coupling, J. Chem. Phys. 152, 084306 (2020). / arXiv
  10. H. Kitoh-Nishioka and K. Ando, Calculation of Charge-Transfer Electronic Coupling with Nonempirically Tuned Range-Separated Density Functional, J. Phys. Chem. C 123, 11351-11361 (2019).
  11. A. Sakurai, K. Ando, and S. Ashihara, Ultrafast proton/deuteron dynamics in KTaO3 observed with infrared pump-probe spectroscopy: Toward understanding of proton conduction mechanism in solid oxides, J. Chem. Phys. 149, 104502 (2018).
  12. R. Sato, H. Kitoh-Nishioka, K. Ando, and T. Yamato, Electron Transfer Pathways of Cyclobutane Pyrimidine Dimer Photolyase Revisited, J. Phys. Chem. B 122, 6912-6921 (2018).
  13. K. Ando, Potential energy surfaces for electron dynamics modeled by floating and breathing Gaussian wave packets with valence-bond spin-coupling: An analysis of high-harmonic generation spectrum, J. Chem. Phys. 148, 094305 (2018). / arXiv
  14. 安藤耕司, 原子価結合局在電子波束による分子内電子励起ダイナミクス, J. Comp. Chem. Jpn.16, 133 (2018).
  15. K. Ando, Localized electron wave packet description of chemical bond and excitation: Floating and breathing Gaussian with valence-bond coupling, Computational and Theoretical Chemistry 1116, 159 (2017). / KURENAI / arXiv
  16. H. Kitoh-Nishioka and K. Ando, FMO3-LCMO study of electron transfer coupling matrix element and pathway: Application to hole transfer between two triptophanes through cis- and trans-polyproline-linker systems, J. Chem. Phys. 145, 114103 (2016). / KURENAI / arXiv
  17. K. Ando, A corpuscular picture of electrons in chemical bond, J. Chem. Phys. 144, 124109 (2016). / KURENAI / arXiv
  18. K. Hyeon-Deuk and K. Ando, Distinct structural and dynamical difference between supercooled and normal liquids of hydrogen molecules, Phys. Chem. Chem. Phys. 18, 2314 (2016). / KURENAI

その他 (ORCiD)


著書


和文解説等

  1. 安藤耕司, Pythonによる化学シミュレーション, 現代化学 2022年4月号-2024年3月号.
  2. 安藤耕司, 水素結合とは何か, 現代化学 2021年7月号 No.604, pp.42-47 (2021).
  3. 安藤耕司, トンネル効果とは何か, 現代化学 2020年1月号 No.586, pp.17-22 (2020).
  4. 鬼頭-西岡宏任, 安藤耕司, 光合成反応中心における長距離電子移動の経路解析, 高次π空間の創発と機能開発 pp.203-207 (2013). (プレプリント, PDF 374 KB)
  5. 安藤耕司, 電荷平衡法の電子移動反応系への応用, 機能材料 Vol. 25, No. 11, pp.35-42 (2005). (プレプリント, PDF 364 KB)
  6. 安藤耕司, 溶液内や光合成反応中心の電子移動における量子トンネル効果とコヒーレンス, 物性研究 Vol. 72, pp.240-254 (1999). KURENAI
  7. 安藤耕司, 水溶液中の酸電離とプロトン輸送の分子的機構, 電気化学および工業物理化学 Vol. 65, No. 5, pp.342-347 (1997). (プレプリント, PDF 335 KB)

担当講義

2024年度前期

2024年度後期


過去の講義資料

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その他


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